A Faculdade Batista do Rio de Janeiro nasceu em 1994, quando iniciaram-se os trâmites de atendimento às exigências legais para reconhecimento dos seus cursos de Teologia, Música e Pedagogia. Naquele momento foi criada a Faculdade de Ciências da Educação (FACE), para ministrar o curso de Pedagogia. Posteriormente, em 2002, iniciou os procedimentos para autorizar todos os seus cursos, alterando seu nome para Faculdade Batista do rio de Janeiro (FABAT). Estas alterações foram realizadas e aprovadas nas instâncias internas e pela mantenedora ainda em 2002. A aprovação última aconteceu na Convenção Batista Brasileira, em março de 2003. Com isso surgia então a instituição legal do Seminário do Sul para oferecer seus cursos regulamentados pelo Ministério da Educação (MEC).